Капитан Уиллард получает секретное задание: пройти вверх по реке вглубь Камбоджи, чтобы найти и ликвидировать полковника Курца, который, сошедши с ума, основал в джунглях собственный жестокий культ. Путешествуя на катере в компании разношёрстной команды, Уиллард постепенно погружается в мрачную реальность войны, где грань между долгом и безумием стирается.
По мере продвижения в сердце тьмы капитан становится свидетелем всё более шокирующих сцен — от абсурдных военных операций до проявлений чистой жестокости. Окружающий хатор и ужас заставляют его задуматься о природе зла и о том, насколько сам он отличается от того, кого должен уничтожить.